viernes, 15 de mayo de 2009

Paper 3!!!


Novel Type IV Secretion System Involved in Propagation of Genomic Islands

Mario Juhas, Derrick W. Crook, Ioanna D. Dimopoulou, Gerton Lunter, Rosalind M. Harding,David J. P. Ferguson, and Derek W. Hood (2007). J. Bacteriol.

Un laboratorio de la Universidad de Oxford estudió el sistema de secreción tipo IV (T4SS) mediante la transferencia horizontal de genes, contribuyendo así con la plasticidad del genoma, la evolución de patógenos infecciosos, la diseminación de resistencia a antibióticos y otros factores de virulencia. Ellos identificaron el gen ICEHin1056 como un T4SS en la bacteria Haemophilus influenzae que está envuelto en la propagación de la isla genómica. Dicen estos científicos que este sistema de secreción tipo IV encontrado es nuevo y revolucionariamente distante de los sistemas tipo IV descritos anteriormente. Un análisis de mutaciones mostró que la inactivación de genes clave en este sistema resulta en la perdida de factores fenotípicos en el sistema. En el laboratorio se realizaron varias mutaciones y siete de diez mutaciones no expresaron el pili del sistema de secreción tipo IV. Correspondientemente, las interrupciones de los genes resultaron en más de 100,000 reducciones del doblamiento en la frecuencia de conjugación comparada a la hebra parental. Por otra parte, la expresión de este sistema fue encontrada para ser regulada positivamente por uno de sus componentes, el gene tfc24. Finalmente los investigadores concluyeron que este grupo de genes representa una familia nueva de T4SS implicado en la propagación de las islas genómica.


Segundo Paper...

Integrons in Xanthomonas: A source of species genome diversity

Michael R. Gillings, Marita P. HolleyH. W. Stokes y Andrew J. Holmes

Los integrones se han conocido por darle resistencia antibiotica a bacterias clinicas. Ellos capturan genes usando una integrasa. Los integrones pueden ocurrir en los cromosomasde muchas bacterias notablemente en la bera y y-proteobacteria. En los xanthomas los integrones fueron encontrados en las 32 cepas. Su localizacion del cromosoma fue por el gen dehydratase IlvD esto sugiriendo que un integron fue presentado anteriormente en los xanthomonad ancestrales. Tambien se encontro que en los cassetes no tenian similitud en otros pathovars. La adquisiocion de cassetes dicersos de diferentes linajes de Xantomonas ha contribuidos a la diversidad de este genero. Tambien se utilizo el DNA ribosomal pra analisar las diferentes identidades de Xanthomonads. Dando de conclusion que los integrones se utilizaron en este genero de planta como metodo de evolucion para tener el genero y las cepas que tenemos hoy en dia.

source original: http://www.pnas.org/content/102/12/4419.full

jueves, 14 de mayo de 2009

Microbial Friends!! 2009

Nosotros somo los Microbial Friends!!! 2009!!!!!!!!!

Felicidades a todos y gracias por ver nuestro blog....



miércoles, 13 de mayo de 2009

Las Nuevas Perspectivas de Producción de Hidrógeno Mediante Algas


La fotosíntesis produce el alimento que comemos y el oxígeno que respiramos. ¿Podría también ayudarnos a satisfacer nuestras necesidades futuras de energía con la producción de un combustible limpio, el hidrógeno? Unos investigadores que estudian un alga unicelular productora de hidrógeno, la Chlamydomonas reinhardtii, han desvelado una vía anteriormente desconocida de fermentación, que podría abrir nuevas posibilidades de aumentar la producción de hidrógeno.

La C. reinhardtii, una habitante muy común de los suelos, produce de forma natural pequeñas cantidades de hidrógeno cuando se la priva del oxígeno.

Como la levadura y otros microbios, bajo condiciones anaerobias, esta alga genera su energía a partir de la fermentación. Durante la misma, se libera el hidrógeno a través de la acción de una enzima llamada hidrogenasa, que se energiza mediante electrones generados por la descomposición de compuestos orgánicos o bien por la del agua a través de la fotosíntesis. Normalmente, sólo una pequeña fracción de los electrones interviene en la generación de hidrógeno. Sin embargo, uno de los objetivos más importantes de la labor de investigación en este campo ha sido el desarrollo de mecanismos que incrementen esta fracción, lo que aumentaría la producción potencial de hidrógeno.

En el nuevo estudio, los investigadores del Departamento de Biología Vegetal del Instituto Carnegie, el Laboratorio Nacional de Energía Renovable (NREL), y la Escuela de Minas de Colorado (CSM), examinaron los procesos metabólicos de una cepa mutante que no era capaz de formar la hidrogenasa de forma activa.

Los científicos ignoraban que esta vía de fermentación metabólica existía en las algas hasta que generaron la cepa mutante.

Este descubrimiento sugiere que existe una flexibilidad significativa en la forma en que las algas verdes terrestres pueden metabolizar el carbono bajo condiciones anaerobias. Bloquear o modificar algunos de estos procesos metabólicos permitiría a los investigadores aumentar la cantidad de electrones cedidos a la hidrogenasa bajo condiciones anaerobias y producir altos niveles de hidrógeno.

Siendo una fuente de energía potencialmente capaz de sustituir a los combustibles fósiles, el hidrógeno puede reducir en gran medida la emisión de gases con efecto invernadero. Los defensores de la producción de hidrógeno a partir de las algas señalan que, a diferencia del etanol producido a partir de cultivos agrícolas, su método no implicaría entrar en competencia con la producción de alimentos, ya que no necesita las tierras agrícolas usadas por los cultivos alimenticios.

Los científicos ignoraban que esta vía de fermentación metabólica existía en las algas hasta que generaron la cepa mutante.

Este descubrimiento sugiere que existe una flexibilidad significativa en la forma en que las algas verdes terrestres pueden metabolizar el carbono bajo condiciones anaerobias. Bloquear o modificar algunos de estos procesos metabólicos permitiría a los investigadores aumentar la cantidad de electrones cedidos a la hidrogenasa bajo condiciones anaerobias y producir altos niveles de hidrógeno.

Siendo una fuente de energía potencialmente capaz de sustituir a los combustibles fósiles, el hidrógeno puede reducir en gran medida la emisión de gases con efecto invernadero. Los defensores de la producción de hidrógeno a partir de las algas señalan que, a diferencia del etanol producido a partir de cultivos agrícolas, su método no implicaría entrar en competencia con la producción de alimentos, ya que no necesita las tierras agrícolas usadas por los cultivos alimenticios.



source original: http://www.amazings.com/ciencia/noticias/080509c.html


Abstracts!!!!!

Primer abstract:

Phan, M. 2009.Variation in Salmonella enterica Serovar Typhi IncHI1 Plasmids during the Global Spread of Resistant Typhoid Fever.
Antimicrob Agents Chemother. 53:2.

Un laboratorio en Londres estudió la resistencia a sulfonamida en Escherichia coli. La resistencia a sulfonamida es prevalente en Escherichia coli a pesar que se ha disminuido el uso de este antibiótico. Caracterizaron dos plásmidos que tenían el gen sul2 el cual permite resistencia a sulfonamida. Entre los 33 plásmidos conjugativos y los 5 plásmidos no conjugativos que tienian el gen sul2 fue común encontrar resistencia a otros antibióticos como ampicilina, estreptomicina u trimetroprim, además de genes de resistencia a mercurio. El potencial de virulencia encontrado en los genes iutA y traT se encontraba en un cuarto de los plásmidos. Las secuencias que contenían el gen sul2 eran diversas lo que sugiría varios mecanismos de movilidad genética. Ellos proponen que la persistencia de este gen a pesar de el uso disminuido de este antibiótico se deba a una coseleccion debido a los antibióticos todavía en uso y que no presenta ninguna carga para la bacteria continuarlo teniendo.

Nuevo Método Para Producir Proteínas Utiles


Un nuevo metodo desarollado por ingenieros en la Universidad de Cornell, permitirá la obtención de proteínas para uso medicinal o industrial, sin tener que emplear células vivas. Muchas de esas proteínas no pueden producirse mediante la biotecnología convencional. Actualmente se utilizan bacterias modificadas genéticamente o células mamíferas también adaptadas que producen proteínas para uso farmacéutico, como la insulina o la hormona humana del crecimiento. Pero hay muchas proteínas que las bacterias o las células de otros organismos no pueden tolerar. Los productos antimicrobianos, por ejemplo, podrían matar a las bacterias que los producen, y muchas proteínas cruciales para regular la vida normal de una célula, podrían matar al organismo productor si son producidas en cantidades excesivas.

En trabajos anteriores, se ha intentado mezclar el ADN que codifica la proteína deseada, con los aminoácidos que la componen, junto con los ribosomas (las estructuras celulares que ensamblan las proteínas) y otros coadyuvantes químicos en un tubo de ensayo. El proceso sobre el que han trabajado los especialistas de la Universidad Cornell es más rápido y eficiente, al colocar el ADN codificador en un gel artificial hecho de ADN sintético.

source principal: http://www.amazings.com/ciencia/noticias/060509b.html

Lo Que Pueden Desvelar Sobre Cambios Climáticos las Bacterias Atrapadas en el Hielo



Unos científicos del Instituto de Investigación de la Meseta tibetan han comprobado que las bacterias atrapadas en el hielo pueden dar informacion de como estan cambiando nuestro clima.
Los expertos encontraron que la abundancia bacteriana, con su valor mínimo en 1938 y el máximo en 1997, aumentó de acuerdo con los niveles de oxígeno-18, un isótopo natural y estable de oxígeno conocido por estar bien correlacionado con la temperatura. Normalmente, la concentración de oxígeno-18 en el hielo sube en los años más calurosos.

Las bacterias también aumentaron con los niveles de polvo en el núcleo, según descubrieron los científicos al medir los niveles de calcio en las capas polvorientas visibles. El polvo probablemente fue transportado al glaciar durante la temporada primaveral de tormentas de polvo, quedando luego atrapado.

source principal : http://www.amazings.com/ciencia/noticias/060209c.html